Microbiologie ![]() |
Bacteriegroei Bacteriën zijn bekend om hun ontzettend snelle groei, hieronder een beschrijving van de bacteriegroei met de volgende onderwerpen: Brengt men een bacteriecel in een vloeibare voedingsbodem, waarin zij zich kan vermeerderen, en gaat men op gezette tijden na hoe deze vermeerdering voortschrijdt, dan vindt men dat de ontwikkeling zich voltrekt in vier fasen, te weten:
Lagfase Wanneer men een bacteriecellen in een vers vloeibaar medium suspendeert, heeft de bacterie een aanpassingsperiode nodig waardoor het aantal cellen niet onmiddellijk in aantal toeneemt.(Lag betekent dralen of treuzelen) Ondertussen gebeurt er wel degelijk wat in elke bacteriecel:de grootte neemt toe doordat er met behulp van de stoffen in het nieuwe medium macromoleculen te gevormd worden, zoals ATP-moleculen voor de energievoorziening, ribosomen voor de eiwitsynthese en enzymen die nodig zijn voor de biochemische processen. De duur van deze lagfase is afhankelijk van:
zie ook de volgende grafiek 1 , hoe hoger de temperatuur hoe sneller alles klaar is Logfase Een Chinese legende verduidelijkt wat exponentiële groei betekent. De keizer van China was zo verrukt over het schaakspel, dat hij de uitvinder een beloning aanbood. De uitvinder mocht zelf kiezen wat hij wilde, behalve uiteraard het keizerrijk. De gewiekste uitvinder vroeg om één rijstkorrel op het eerste speelveld van het schaakbord, en twee op het tweede, vier op het derde, enzovoort, totdat het bord met 64 velden vol zou zijn. „Wat een bescheiden man!” dacht de keizer aanvankelijk, en gaf opdracht wat rijst aan te laten rukken. Maar de uitvinder was de keizer te slim af. Als je de exponentiële trend doortrekt –zoals één korrel op het eerste veld, twee op het tweede, vier op het derde, enzovoort– is er voor het laatste veld van het schaakbord de gigantische oppervlakte van twee keer de aarde nodig. Je kan de toename in een grafiek weergeven, waarbij men de tijd op de horizontale as uitzet en de getelde aantallen bacteriën op de logaritmisch ingedeelde verticale as. Het hoge aantal micro-organismen die in bovengenoemd voorbeeld na 24 uur logaritmische groei zijn ontstaan worden in werkelijkheid nooit bereikt. (Gelukkig maar want bij deze aantallen zou na twee dagen een volume van 10.000 maal het volume van onze aardbol.) Dit is een situatie, die in de praktijk niet kan ontstaan door een combinatie van de volgende factoren: voor alle bacteriën geldt dat de groeisnelheid evenredig is met de snelheid van de energiestofwisseling, d.i. met de productiesnelheid van de ATP-moleculen. Deze productie kan gestoord worden, zowel door de toxische stoffen die uit eigen stofwisseling ontstaan, als door gebrek aan de benodigde elementen in de voedingsbodem. Men neemt aan dat deze twee factoren, toxische stoffen en gebrek aan groeifactoren in de voeding, de belangrijkste rol spelen bij het beëindigen van de log-fase en het overgaan in de volgende fase, de stationaire fase.
In de stationaire fase neemt het aantal levende cellen in een populatie niet meer toe. De vorming van nieuwe cellen is gelijk aan de afsterving van cellen. Voor sommige organismen duurt deze fase slechts kort, enkele uren, voor andere kan het enkele dagen duren. Wanneer in de log-fase veel toxische stoffen werden opgestapeld, begint het afstervingsproces snel. Zodra dit proces begint, lgaan de cellen kapot onder invloed van enzymen die normaal in de celwandsynthese bij delende cellen werkzaam zijn en nu in de niet-delende cellen door hun activiteit de celwand verzwakken. Hiermee treedt de vierde fase in die tot het afsterven van de gehele populatie leidt. De snelheid van dit proces is ook exponentieel, d.w.z. dat er per tijdseenheid steeds meer cellen doodgaan totdat bijna alle cellen dood zijn. Van de overblijvende levende vegetatieve cellen is verder bekend dat, wanneer ze overgeënt worden in een vers vloeibaar medium, ze een veel langere lag-fase nodig hebben om zich op de deling van de log-fase voor te bereiden dan bacteriën overgeënt vanuit een cultuur die in de log-fase verkeerde. Deze laatste bacteriën hebben geen aanpassing in een lag-fase nodig, mits het medium waarin ze overgeënt worden gelijk is aan het medium waar ze uit gehaald werden en de media dezelfde temperatuur hebben. Wanneer gesproken wordt van een oude cultuur, dan wordt daarmee bedoeld een cultuur die niet meer in de log-fase verkeert. Wat betreft de leeftijd van bacteriële cellen, die zich allemaal door deling voortplanten, kan men moeilijk spreken van jeugd, ouderdom en dood, tenzij men er duidelijk een andere betekenis aan geeft dan in het normale spraakgebruik. De afsterving wordt verder behandeld in de afsterving van micro-organismen De beschreven groeikenmerken betreffen in hoofdzaak bacterieculturen in vloeibare media. Op een vaste voedingsbodem zijn de omstandigheden anders. Ook de groei van bacteriën, aangepast aan deze omstandigheden, verloopt daarom anders. Op vaste voedingsbodems geënte bacteriën hebben vòòr het proces van de deling begint een lag-fase nodig. Daarna begint de log-fase met de deling (en dus de exponentiële groei). Doordat de dochtercellen echter op één plaats gelokaliseerd blijven is de beschikbaarheid van de voedingsstoffen en zuurstof voor die dochtercellen heel anders is dan in een vloeibaar medium. Hierdoor verloopt het groeiproces na de eerste delingen niet gelijk aan het groeiproces in een vloeibaar medium. In het centrum van een kolonie ontstaat zuurstofgebrek, de beschikbaarheid van nutriënten daalt daar ook snel, er is een ophoping van toxische stofwisselingsproducten zoals zuren welke. het celdelingsproces remmen, zodat de groei in een kolonie hoofdzakelijk plaatsvindt aan de rand. In één kolonie verkeren dus cellen in de log-fase aan de rand tegelijk met andere cellen in de stationaire en afstervingsfase in het centrum van de kolonie. Om een cultuur te bewaren en in leven te houden zijn er verschillende methoden mogelijk. Een reincultuur kan men op een schuine agar bewaren. Men ent de stam en incubeert de agar tot er redelijke groei te zien is. De agar wordt goed afgesloten om uitdrogen te voorkomen en in de koelkast bewaard. Sommige micro-organismen kunnen zo een week, andere weken tot maanden in leven worden gehouden. Af en toe worden ze overgeënt op een nieuwe agar. In sommige gevallen, wanneer vaste agar niet voldoet, wordt de stam in vloeibaar medium bewaard. Om micro-organismen langer te bewaren kan men ze ook invriezen of vriesdrogen, zodat de biochemische activiteiten zeer sterk worden gereduceerd. Invriezen kan gebeuren in het medium zelf maar vaak wordt een beschermend middel toegevoegd zoals glycerol of saccharose. Buizen worden meestal snel ingevroren met behulp van aceton-droogijs of vloeibare stikstof. Micro-organismen met kwetsbare celwanden worden bij voorkeur langzaam ingevroren. De culturen kunnen bij -20 0C, maar beter nog bij -70 0C bewaard worden. Vriesdrogen is het onttrekken van water aan een cultuur onder vacuüm, nadat de cultuur eerst bij - 70 werd ingevroren. Wanneer de cultuur gedroogd is, wordt het buisje onder vacuüm afgesloten. Het kan bij kamertemperatuur worden bewaard. Het is op deze manier mogelijk een verzameling van stammen aan te leggen die gebruikt worden voor bijvoorbeeld kwaliteitscontrole.. Hier onder wat opdrachten waarmee je bovenstaande stof kunt leren of na kunt gaan of je nog weet wat je gelezen hebt. Wat is de generatietijd van een micro-organisme? Welke omstandigheden hebben allemaal invloed op de generatietijd? Noem er zo veel mogelijk, denk hierbij aan de reader Micro-organismen en milieu.. Opgaven bij groeifasen Geef deze vier fasen aan in een grafiek. Welke voorbereidingen treft een cel voordat deze zich kan delen? Leg uit welke omstandigheden de lengte van de lagfase beïnvloeden. Opgaven bij het de logfase Opgave 1. Zet de toename van het aantal micro-organismen op grafiekpapier uit: Ga hierbij uit van één micro-organismen aan het begin welke een delingstijd heeft van 20 minuten. Er is geen lagfase. Begin bij tijdstip 0 en zet de eerste 10 delingen uit dus eindig bij 200 minuten op grafiekpapier. Hoe loopt de grafiek die je getekend hebt? Hoeveel micro-organismen zijn er na 200 minuten ? Oefening 1.b. Zet de toename van bovenstaand micro-organismen nog eens uit op hetzelfde grafiekpapier, maar zet nu 10log aantal micro-organismen uit tegen de tijd. Hoe ziet deze grafiek eruit? Klik hier voor antwoorden 1 Oefening 1c. Waarom zet men de groei van micro-organismen bij voorkeur (half)logaritmisch uit ? Opgave 2 a.Vul onderstaande tabel aan:
Klik hier voor antwoord 2 b.Hoeveel micro-organismen zijn er na 24 uur? c.Hoeveel micro-organismen zijn er uitgaande van 3 micro-organismen aan het begin na 24 uur?
Uit vorige opgave wordt duidelijk dat het aantal micro-organismen op een bepaald tijdstip afhangt van:
Met deze gegevens is het dus mogelijk het aantal micro-organismen per ml te voorspellen. Hierbij is een grafiek niet nodig, het kan ook met een formule. Nt = N0 x 2n Nt = het aantal micro-organismen op tijdstip t N0 = het aantal micro-organismen op tijdstip 0 n = het aantal delingen dat plaatsvindt in de tijd t Het rekent vaak gemakkelijker om de logaritme van de aantallen te nemen. De formule wordt dan: Log Nt = Log N0 + nlog2 Bij onderstaande opgaven mag je 0,301 (log 2) afronden op 0,300 Opgave 3 Ga eens na of je de vragen uit opgave 1 ook met de formule kunt beantwoorden. Klik hier voor het antwoord Opgave 4 Bereken met de formule hoeveel micro-organismen er aanwezig zijn na 24 uur bij een aanvangsbesmetting van 10 micro-organismen per ml? De generatietijd = 20 minuten Klik hier voor het antwoord Opgave 5 Op een bepaald moment bevat een bouilloncultuur 103 micro-organismen per ml, 10 uur later zijn er 109 micro-organismen per ml. Wat is de generatietijd van het micro-organisme? En wat de delingssnelheid? Wanneer zijn er 1012 micro-organismen per ml? Zet de groei uit in een grafiek en zoek ook op deze manier ook het antwoord op de vorige vraag. Klik hier voor de antwoorden Om 6 uur s’avonds zijn er 103 micro-organismen per ml Om 7 uur s’avonds zijn er 104 per ml. Wanneer zijn er 1015 micro-organismen per ml? Wanneer zijn er 2 x 1015 micro-organismen per ml? Klik hier voor de antwoorden. Opgave 7 Gehakt wordt gekocht bij de slager, gekoeld vervoerd en thuis direct in de koelkast gezet. Dit alles bij 4°C. Vervolgens wordt het 3 dagen bewaard. De generatietijd van de aanwezige micro-organismen is 9 uur bij 4°C. Bij aankoop zaten er 106 micro-organismen per gram in het gehakt. De bederfgrens is 109 per gram. Opgave 8 Klik hier voor het antwoord. Oefeningen bij het bewaren van reinculturen> Welke drie methoden zijn er om een cultuur aan te houden?
Opgave 3: Log Nt = Log N0 + nlog2 Log Nt = log1 + nlog2 Log Nt = 0 + 10 x 0,301 Log Nt = 3,01 Nt = 103,01= 1024 Opgave 4 Log Nt = Log N0 + nlog2 Log Nt = log10 + nlog2 Log Nt = 1 + 10 x 0,301 Log Nt = 4,01 >Nt = 104,01= 10.024 log Nt = Log N0 + nlog2 Log 109 = log103 + n0,3 9 = 3 + 0,3n 6 = 0,3n n = 20 20 delingen in 10 uren 1 deling in een half uur = 30 minuten,
Opgave 6 Opgave 6 Opgave 6 Opgave 6 Log Nt = Log N0 + nlog2 Log 104 = log103 + n0,3 0,3.n = 1 n = 3,33 3,33 delingen in 1 uur Log Nt = Log N0 + nlog2 Log 1015 = log103 + n0,3 12 = 0,3.n Er zijn 40 delingen nodig om van 103 naar 1015 micro-organismen te komen. Dat duurt 40 x 18 minuten = 12 uren Na 18 minuten weer een verdubbeling = 2 x 1015 per ml Log Nt = Log N0 + nlog2 3 dagen = 72 uren = 8 delingen LogNt = log106 + 8x0,3 LogNt = 6 + 2,4 Nt = 108,4 = minder dan 109 : nog (net) niet bedorven! Opgave 8 Log Nt = Log N0 + nlog2 Log 105 = log101 + n0,3 In totaal 980 minuten. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||