Doel van de stofwisseling
Uiteindelijk doel voor de bacterie de vermeerdering van het aantal cellen, dus aanmaak nieuw celmateriaal, dus groei

Wat is stofwisseling?
Stofwisseling is het vormen van een stof uit een andere stof.
In een bacterie vinden duizenden van deze reacties tegelijk plaats. Er zijn twee soorten stofwisselingsprocessen:

Brandstof-stofwisseling of de energiestofwisseling of de dissimilatie
Door de afbraak (oxydatie of verbranding) van brandstoffen worden voor de cel bruikbare energierijke verbindingen (ATP) gevormd. Deze afbraak van een brandstof gaat stapsgewijs. Voor elke stap is een eigen (specifiek) enzym nodig. 
Op grond van hun energiestofwisseling zijn micro-organismen in groepen te onderscheiden en in de praktijk te herkennen ; zo kunnen niet alle micro-organismen lactose afbreken, zodat onderscheid mogelijk is , zie identificatie

Bouwstof-stofwisseling of de biosynthesestofwisseling of de assimilatie
uit bouwstoffen worden met behulp van ATP de celstructuren en noodzakelijke enzymen gemaakt. Hierbij worden eenvoudige moleculen tot veel grotere moleculen opgebouwd zoals enzymen en DNA, of nog grotere structuren zoals bijvoorbeeld de celwand.
Dit gaat onvoorstelbaar snel: een Escherichia coli-cel vormt per seconde 12000 lipiden en 3000 eiwitmoleculen.
Deze processen worden mogelijk gemaakt door de werking van honderden verschillende enzymen. en de ATP gewonnen bij de brandstof-stofwisseling
Elk micro-organisme heeft zijn eigen specifieke set enzymen waardoor herkenning en determinatie tot op de soort mogelijk is. zie identificatie

Let op: de brandstof stofwisseling maakt door afbraak van een brandstof geschikte energie, ATP, vrij die nodig is voor de bouwstofstofwisseling .